益生菌的作用有很多，例如，益生菌可合成消化酶，参与肠道的消化吸收，有利于促进营养物质的吸收利用。
其次，益生菌的自身结构可作为抗原直接发挥免疫激活作用，可以刺激宿主的免疫系统，增强免疫功能。
此外，益生菌还能维持肠道菌群结构平衡，降低肠道黏膜渗透性，保护肠道黏膜屏障，维持肠道健康。
因此，若出现免疫力低下、消化不良或者出现肠炎时，患者都可以适当服用益生菌。
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