肺结核治疗的疗程是根据患者的具体情况决定的。如果是初筛的肺结核患者，他的疗程在半年左右;如果是复治的肺结核患者，需要治疗9个月;如果是耐多药的肺结核患者，他的治疗周期比较长，一般需要18-24个月，并且还要根据痰检的结果以及肺部CT的病灶变化情况具体决定;如果是肺结核合并有其他部位的结核，如结核性脑膜炎，他的治疗可能需要一年到一年半左右，并且需要根据脑脊液的检查结果决定是否停用。
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