百适滴益生菌服用方法是温开水或凉水冲服，避免开水冲服，特别是散剂，开水会杀灭部分活菌影响治疗效果。在餐后半小时或1小时服用，如空腹服用，胃酸会造成部分活菌失活，减弱益生菌效果。
与其他药物联用需注意服药间隔，特别是抗生素类药物，抗生素可以杀灭细菌，尤其是口服抗生素，能减少益生菌活菌量，减弱治疗效果，应与抗生素至少间隔1小时服用。其他药物如铋剂、质子泵抑制剂、抑酸剂等，包括泮托拉唑、艾司奥美拉唑等，对益生菌也有影响，建议隔开口服。
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