截至目前，牡丹江有七所大学，包括牡丹江医学院、牡丹江师范学院两所本科大学和牡丹江大学、黑龙江林业职业技术学院、黑龙江农业经济职业学院、黑龙江商业职业学院、黑龙江幼儿师范高等专科学校五所专科大学。
说明：这是教育部公布的普通高校名单，没有包含军事类院校。
牡丹江医学院简介：
牡丹江医学院位于黑龙江省牡丹江市，是黑龙江省属普通本科医药院校，是黑龙江省特色应用型本科高校建设单位、中国全国首批卓越医生教育培训计划项目试点高校，2015年在教育部临床医学专业认证中获得了6年有效期。
学校由1946年始建的牡丹江专区医院、1956年始建的黑龙江省卫生干部进修学校于1958年共同创建，历经了牡丹江医学院（1958—1962年）、牡丹江卫生学校（1962—1978年）、牡丹江医学专科学校（1978—1986年）、牡丹江医学院（1986年—）等历史时期，2013年获得硕士学位授予权。
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