甲型H1N1流感的症状是发烧，甲型H1N1流感的潜伏期较流感、禽流感潜伏期长，鼻塞常发生，一星期后复原且少有鼻塞、无流鼻涕。60%患者会有发冷寒战、疲倦、轻微、中度至重度打喷涕，在3-6小时内，急性发作、高烧、疼痛急速出现；部分患者病情可迅速发展，来势凶猛、突然高热、体温超过38℃，甚至继发严重肺炎、急性呼吸窘迫综合症、只有医生可以通过鼻腔、口腔的液体如唾液、鼻水来证明是甲型H1N1流感。少数病例仅有轻微的上呼吸道症状，无发热。体征主要包括咽部充血和扁桃体肿大。检查后再对因治疗发烧可以用退烧药口服或是物理退烧，用冷毛巾敷额头、颈部腋窝等。
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