禽流感的潜伏期在7天以内，一般是1~3天，个别病例可以达到2周。
禽流感患者在潜伏期没有任何症状，过潜伏期后就会出现急性起病。
早期表现与流感非常相似，最常见的临床表现是眼结膜炎和持续的高热。
高热体温一般在39℃以上，热程一般2~4天，可以持续为1周左右。伴随的其他症状，包括流涕、鼻塞、咳嗽、咽痛、全身不适、周身疼痛、头痛、恶心、呕吐、腹泻等。这些症状半数的病人会出现肺炎，迅速发展为重症肺炎，就会危及患者的生命。
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